如何解讀Qubit RNA IQ Assay Kit的檢測(cè)結(jié)果?
Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 是一種用于精確檢測(cè) RNA 質(zhì)量和濃度的工具,以下是對(duì)其檢測(cè)結(jié)果解讀的一些要點(diǎn):
濃度
數(shù)值含義:檢測(cè)結(jié)果會(huì)給出 RNA 的濃度值,單位通常是 ng/μL。這個(gè)數(shù)值表示每微升樣品中所含 RNA 的質(zhì)量。
準(zhǔn)確性:Qubit 系統(tǒng)采用熒光染料特異性地結(jié)合 RNA,能提供高精度的定量結(jié)果,受雜質(zhì)干擾小,比傳統(tǒng)的紫外分光光度法更準(zhǔn)確。例如,若紫外分光光度法檢測(cè)結(jié)果受蛋白質(zhì)等雜質(zhì)影響而偏高,Qubit RNA IQ Assay Kit 則能排除此類干擾,給出更真實(shí)的 RNA 濃度值。
RNA 完整性數(shù)(RIN)
數(shù)值范圍與意義:RIN 值范圍從 1 到 10,10 代表最完整的 RNA,通常認(rèn)為 RIN 值≥7 表示 RNA 質(zhì)量較好,適用于大多數(shù)下游應(yīng)用,如 qRT - PCR、微陣列分析等;RIN 值在 5 - 7 之間,說(shuō)明 RNA 有一定程度的降解,但可能仍適用于一些對(duì) RNA 完整性要求不太高的實(shí)驗(yàn),如普通 RT - PCR;RIN 值<5 則表明 RNA 降解嚴(yán)重,可能會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
評(píng)估方法:該試劑盒通過(guò)分析 RNA 電泳圖譜中 28S 和 18S rRNA 的相對(duì)強(qiáng)度以及它們與其他 RNA 條帶的分布情況來(lái)計(jì)算 RIN 值,能直觀地反映 RNA 的完整性。
28S/18S 比值
正常范圍:對(duì)于真核生物,完整的 RNA 通常具有 28S/18S 比值在 1.8 - 2.2 之間。
比值變化含義:比值高于 2.2 可能表示 RNA 有降解,導(dǎo)致 18S rRNA 丟失相對(duì)較多;比值低于 1.8 可能意味著存在 RNA 的部分降解或污染,例如,可能有基因組 DNA 污染,影響了 28S rRNA 的條帶強(qiáng)度,或者 RNA 在提取過(guò)程中受到了機(jī)械剪切力等因素的影響,使 28S rRNA 斷裂,從而降低了該比值。
在解讀檢測(cè)結(jié)果時(shí),需要綜合考慮濃度、RIN 值和 28S/18S 比值等多個(gè)指標(biāo),以全面評(píng)估 RNA 的質(zhì)量和濃度是否滿足實(shí)驗(yàn)需求。同時(shí),還應(yīng)結(jié)合實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮秃罄m(xù)應(yīng)用來(lái)判斷 RNA 樣品是否合格。例如,對(duì)于構(gòu)建 cDNA 文庫(kù),通常需要高質(zhì)量、高濃度且完整性好的 RNA,即 RIN 值較高、28S/18S 比值正常且濃度足夠的樣品;而對(duì)于一些簡(jiǎn)單的基因表達(dá)分析實(shí)驗(yàn),對(duì) RNA 質(zhì)量的要求可能相對(duì)寬松一些。